細菌的特殊結構包括莢膜、鞭毛、菌毛及芽孢（胞）。為某些細菌所缺乏，而為某些細菌所特有的結構。

　?。ㄒ唬┣v膜及其與細菌致病性的關系

　　莢膜菌在其細胞壁外有一層厚>0.2nm黏稠結構稱為莢膜，其化學成分在多數(shù)菌為多糖。少數(shù)菌為多肽。莢膜具有黏附宿主細胞和抗吞噬等致病作用以及抗原性，并且是鑒別細菌的指征之一。

　　（二）鞭毛及其與醫(yī)學的關系

　　弧菌、螺菌、占半數(shù)的桿菌及少數(shù)球菌，由細胞膜伸出菌體外細長的蛋白性絲狀體，稱為鞭毛。根據(jù)鞭毛菌上鞭毛位置和數(shù)量，分為單毛菌、雙毛菌、叢毛菌和周毛菌。鞭毛是運動器，它使鞭毛菌趨向營養(yǎng)物質而逃避有害物質，且具有抗原性并與致病性有關，例如沙門氏菌的鞭毛抗原即H抗原，具有使菌體穿透腸黏液層侵及腸黏膜上皮細胞的功能。

　　（三）菌毛的定義、分類及其與醫(yī)學的關系

　　1.菌毛許多革蘭氏陰性（G^-）菌及少數(shù)革蘭氏陽性（G⁺）菌在其菌體表面有細而短、多而直的蛋白性絲狀體，稱為菌毛。

　　2.菌毛的分類菌毛分為普通菌毛和性菌毛兩類：①普通菌毛，數(shù)量多，每菌可達數(shù)百根，短而直，直徑3～8nm，長0.2～2微米②性菌毛亦稱F菌毛，每菌僅有1～10根，粗而長、中空呈管狀，它由F質粒表達。性菌毛菌稱為F⁺菌。

　　3.菌毛與醫(yī)學的關系①普通菌毛可促使細菌黏附于宿主細胞表面而致病。②F+菌的菌體內(nèi)質粒或染色體DNA，通過中空的性菌毛與F菌表面相應的受體接合（conjugation），可將遺傳信息，如細菌毒力、耐藥性及耐熱性等，傳遞給F.受體菌，使之獲得新的遺傳性狀。此外，性菌毛也是某些噬菌體的受體，使噬菌體吸附于F^-菌，并使后者獲取致病物質，如霍亂弧菌獲取霍亂腸毒素。

　　（四）芽孢（胞）及其與醫(yī)學的關系

　　需氧芽孢（胞）桿菌屬或厭氧芽孢（胞）梭菌屬的細菌繁殖體，當處于不利的外界環(huán)境中，在菌體內(nèi)形成厚而堅韌芽孢（胞）壁及外殼的圓形或卵圓形小體，稱為芽孢（胞）。它為細菌的休眠狀態(tài)，其抵抗力遠遠大于繁殖體，是滅菌效果的指征。芽孢（胞）可存活在自然界數(shù)年以上，一旦條件適宜，又能出芽回復為繁殖體而致病。例如炭疽、破傷風、肉毒中毒和氣性壞疽等，均由芽孢（胞）菌引起。