在病理狀態(tài)下，粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)（RER）可發(fā)生量和形態(tài)的改變。在蛋白質(zhì)合成及分泌活性高的細胞（如漿細胞、胰腺腺泡細胞、肝細胞等）以及細胞再生和病毒感染時，粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)增多。粗面肉質(zhì)崗的含量高低也常反映腫瘤細胞的分化程度。相反，在萎縮的細胞（如饑餓時）以及有某種物質(zhì)貯積的細胞，其粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)則萎縮、減少。當細胞受損時，粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的核蛋白體往往脫落于胞漿內(nèi)，粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的蛋白合成乃下降或消失；當損傷恢復時，其蛋白合成也隨之恢復醫(yī)學教育網(wǎng)|搜集整理。

在由各種原因引起的細胞變性和壞死過程中，粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的池一般出現(xiàn)擴張，較輕的和局限性的擴張只有在電鏡下才能窺見，重度擴張時則在光學顯微鏡下可表現(xiàn)為空泡形成，電鏡下有時可見其中含有中等電子密度的絮狀物。在較強的擴張時，粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)同時互相離散，膜上的顆粒呈不同程度的脫失。進而內(nèi)質(zhì)網(wǎng)本身可斷裂成大小不等的片段和大小泡。這些改變大多見于細胞水腫時，故病變不僅見于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)，也同時累及Golgi器、線粒體和胞漿基質(zhì)，有時甚至還累及溶解體。