成都中醫(yī)藥大學醫(yī)學信息工程學院以信息化促進我國醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展是國家的重大發(fā)展戰(zhàn)略，醫(yī)學信息工程專業(yè)是我國醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展的朝陽學科。2012年學校整合校內(nèi)優(yōu)勢資源，組建了全新的醫(yī)學信息工程學院，2013年開始招收4年制醫(yī)學信息工程專業(yè)本科學生。

學院擁有從事教學、科研、網(wǎng)絡技術服務的專業(yè)團隊43人，其中教師隊伍高級職稱比率達到30%，擁有國家中醫(yī)藥管理局重點培育學科——中醫(yī)藥信息學，以及數(shù)字醫(yī)藥工程、醫(yī)學信息和計算機基礎3個教研室。

學院與學校數(shù)字醫(yī)藥研究所醫(yī)|學教育網(wǎng)搜集整理、現(xiàn)代教育信息技術中心三位一體，集成了科研、教學和網(wǎng)絡應用管理的多方優(yōu)勢。其中，數(shù)字醫(yī)藥研究所在中醫(yī)藥信息化領域的研究水平居全國領先。代表項目有中藥行業(yè)的第一個物聯(lián)網(wǎng)項目——“中藥溯源系統(tǒng)研究”，該項目2011年得到國家商務部、藥監(jiān)局、中醫(yī)藥管理局的聯(lián)合試點批文，2012年國家投入資金已超過1個億，是惠及民生的“放心中藥”工程； 國家重大專項“慢性傳染病證侯生物信息平臺研究”得到了國家科技部十一五、十二五持續(xù)支持；承擔的全國第四次中藥資源普查“動態(tài)預警及省級數(shù)字化平臺”研究也取得重要進展；與世界網(wǎng)絡設備企業(yè)思科公司合作的“地震災區(qū)基層衛(wèi)生信息系統(tǒng)研究”創(chuàng)造了數(shù)字中醫(yī)診療軟件開發(fā)多個全國第一……研究所目前在國內(nèi)數(shù)字化中醫(yī)診療系統(tǒng)、中藥與互聯(lián)網(wǎng)、中醫(yī)生物信息等領域擁有數(shù)十個軟件成果和專利技術。現(xiàn)代教育信息技術中心是國家中藥現(xiàn)代化（四川）基地的信息化支撐單位，在負責全校的“數(shù)字化校園”建設工作的同時，承擔了大量四川省中醫(yī)藥行業(yè)信息化任務。學院擁有全國中醫(yī)院校的網(wǎng)絡設備、信息化系統(tǒng)和測試實驗室、軟硬件開發(fā)環(huán)境。