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西元1895年,日人在臺北府城立臺病院(此即臺大院的前身),1896年6月改臺北病院,1897年臺北病院立所始招生授,1899年正式成立「臺督府校」,1919年改制「臺督府!,1922年改「臺北!。
1928年臺北帝大校,立之初未部,後以臺北校基,在1936年成立臺北帝大部,原臺北校改臺北帝大部。
1937年臺北院(原臺北病院)成臺北帝大部附院。
1945年臺光,政府接收臺北帝大更名立臺大,部改院,附院改院附院,部不再招生。
本院於光之初,除科外未其他系,1946年春,收容留日返臺之生,曾成立修科,至1950年停。
嗣於42年度增系,44年度增牙系,45年度增理系及事技系,56年度事技系分事及物理治,59年度增健系分物理治及能治,同事技系物理治健系,61年度增公共生系,62年度起奉教育部令科更名系。
71年度增士後系,74年度士後系奉準停止招生。81年度健系撤,改物理治系及能治系。醫(yī)'學教育網(wǎng)|整理82年度公共生院成立,公共生系改公共生院。本院有七系(其中系包括基及床共27科),其修年限,系、理系、事技系、物理治系及能治系等四年,後分授予士、理士之位;系七年制,其最後一年床,後授予士位;牙系六年制,後授予牙士位。
本院於光之初自日人接收研究所,未招生,嗣於1951年予以改另公共生研究所。36年度增生理研究所、病理研究所、核病研究所,其中核病研究所於38年度入理院化系。
51年度原有之生理研究所分生理研究所、理研究所及生化研究所。
54年度增微生物研究所。
56年度生化研究所及理研究所增博士班。
58年度增解剖研究所,病理研究所增博士班。
59年度增研究所。
67年度增床研究所,置博士班。
72年度研究所增博士班。
73年度增理研究所。
74年度公共生研究所增博士班,系增家庭科。
75年度微生物研究所及解剖研究所增博士班。
76年度增事技研究所。
77年度增牙科研究所。
78年度生理研究所增博士班。
79年度增毒理研究所。
81年度增分子研究所。
82年度增毒理研究所博士班及免疫研究所,系增急科,公共生研究所改公共生院。
87年度牙科研究所更名床牙研究所,85年度免疫研究所增博士班,85年度床研究所博士班增外科。
86年度理研究所增博士班,新成立口腔生物科研究所士班及物理治系士班。
87年度增工程研究所士班(工院合)。目前本院共有16研究所,其修年限,士班一至四年,博士班二至七年。
本院另於1987年成立雷射研究中心,於1990年成立物中心及工程研究中心,行相域之研究。
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