吉林省中醫(yī)藥科學(xué)院始建于1958年10月，原名為吉林省中醫(yī)研究所，1962年更名為吉林省中醫(yī)中藥研究所，1984年11月更名為吉林省中醫(yī)中藥研究院，2003年加掛吉林省中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院的牌子，2007年9月正式更名為吉林省中醫(yī)藥科學(xué)院。

近年來，省中醫(yī)藥科學(xué)院緊跟時代步伐，發(fā)展創(chuàng)新、大膽改革，投入大量資金搞建設(shè)、購設(shè)備醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)編輯整|理、引進人才，加大科研資金匹配和重點實驗室建設(shè)，加強臨床重點?？坪托畔⒕W(wǎng)絡(luò)建設(shè)，全面提升科研和醫(yī)療服務(wù)綜合實力。目前已發(fā)展成為一所集科研、醫(yī)療、教學(xué)、生產(chǎn)四位一體的綜合性中醫(yī)藥科研院所，也是我國中醫(yī)藥七大研究基地之一，并先后獲得了"全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進單位"、"中醫(yī)藥科技管理先進集體"、"中國中西醫(yī)結(jié)合先進單位"、"全省中醫(yī)藥工作先進單位"等榮譽稱號。