濟寧醫(yī)學院的前身是創(chuàng)建于1952年的山東省濟寧醫(yī)士學校，位于山東省濟寧市，1958年改為濟寧醫(yī)學院，招收第一屆本科生；1959年改為濟寧醫(yī)學?？茖W校； 1987年1月，經(jīng)原國家教育委員會批準，更名為濟寧醫(yī)學院；2008年4月學校以“優(yōu)秀”成績順利通過國家教育部本科教學工作水平評估。

截至2013年6月，濟寧醫(yī)學院有濟寧、北湖、日照3個校區(qū)，占地總面積為124萬余平方米，建筑面積67萬余平方米。學校固定資產(chǎn)總值9.45億元，其中教學科研儀器設備總值1.9億元，館藏圖書總量為150余萬冊。北湖校區(qū)坐落在孔孟之鄉(xiāng)、禮儀之邦、素有江北小蘇州之稱的濟寧市北湖新區(qū)。日照校區(qū)坐落在黃海之濱、素有“東方夏威夷”之稱的日照市。

截至2013年6月，學校有15個教學院系部，下設35個本科專業(yè)和專業(yè)方向，涵蓋醫(yī)、理、工、管、文五個學科門類。有1個一級學科專業(yè)碩士學位授權(quán)點。學校面向全國26個省、市、自治區(qū)招生，有全日制在校研究生、本、?？粕?6800余人。有計劃的招收部分國家或地區(qū)留學生。