病毒對敏感細胞的感染并不一定都能繁殖病毒，產生有感染性的病毒子代。由于病毒或細胞的原因，使病毒的復制在病毒進入敏感細胞后的某一階段受阻，導致病毒感染的不完全循環(huán)，不產生有感染性的病毒子代。

　　缺損病毒

　　有些病毒由于缺乏某些基因，單獨感染細胞時不能復制出完整的、具有感染性的病毒顆粒，需要其它病毒基因組或病毒基因的輔助活性，否則，即使在活細胞內也不能復制。有生物活性的缺損病毒包括4類醫(yī)學|教育網搜集整理：

　　1）干擾缺損病毒。又稱干擾缺損顆粒（defective interfering particles，DI顆粒），是病毒復制時產生的一類亞基因組的缺失突變體，必須依賴于其同源的完全病毒才能復制。DI基因組比其完全病毒小，復制更迅速，在與其完全病毒共感染時易占據(jù)優(yōu)勢，從而干擾其復制。

　　2）衛(wèi)星病毒。寄生于與之無關的輔助病毒的基因產物的病毒。基因組缺損，必須依賴于輔助病毒才能復制，它不是由其輔助病毒的基因缺失產生的，是存在于自然界中一種絕對缺損病毒，形態(tài)結構和抗原性都與輔助病毒不同，基因組很少有同源性。衛(wèi)星病毒現(xiàn)劃歸在亞病毒因子的衛(wèi)星之中。

　　3）條件缺損病毒。是一類基因組發(fā)生了突變的病毒條件致死突變體，在允許條件下能夠正常繁殖，在限制條件下導致流產感染，也能干擾野生型病毒復制。

　　4）整合的病毒基因組。某些溫和噬菌體和腫瘤病毒感染宿主細胞后，病毒基因組整合于宿主染色體，并隨細胞分裂傳遞給子代細胞。除非缺損的外源性RNA腫瘤病毒外，病毒整合感染的細胞沒有感染性的病毒產生，只有在一定條件下，整合在宿主染色體的病毒基因組才能轉入復制循環(huán)，產生有感染性的病毒顆粒。

　　頓挫病毒

　　有些宿主細胞不能全部提供病毒復制所需的必要因子，致使所復制的病毒為不完整的、無感染性的病毒顆?；騺嗩w粒。這類感染過程有以下3種類型：

　　1）流產感染。流產感染分為依賴于細胞的流產感染和依賴于病毒的流產感染。病毒感染的細胞是病毒不能復制的非允許細胞，將導致依賴于細胞的流產感染。非允許細胞內，缺失某些參與病毒復制的酶、tRNA或細胞因子，往往僅有少數(shù)病毒基因表達，不能完成病毒復制循環(huán)。允許細胞和非允許細胞是相對的，一種病毒的允許細胞可能是另一種病毒的非允許細胞，反之亦然。依賴于病毒的流產感染是由基因組不完整的缺損病毒引起，無論是感染允許細胞還是非允許細胞都不能完成復制循環(huán)。

　　2）限制性感染。因細胞的瞬時允許性產生，其結果或是病毒持續(xù)存在于受染細胞內不能復制，直到細胞成為允許性細胞，病毒才能繁殖，或是一個細胞群體中僅有少數(shù)細胞產生病毒子代醫(yī)學|教育網搜集整理。

　　3）潛伏感染。在受染細胞內有病毒基因組持續(xù)存在，但并無感染性病毒顆粒產生，而且受染細胞也不會被破壞。潛伏感染的另一個極端情況是由于病毒基因的功能表達導致宿主基因表達的改變，以致正常細胞轉化為惡性細胞。