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基于網(wǎng)絡(luò)分層鑒別癌癥亞型的新方法

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腫瘤幾乎從來就沒有共享過完全相同的遺傳突變,這使得人們?yōu)楦玫貙┌Y類型分門別類、以及開發(fā)出更有效的靶向性治療所付諸的科學(xué)努力面臨困難重重。

現(xiàn)在,來自加州大學(xué)圣地亞哥分校研究人員提出了一種稱作為基于網(wǎng)絡(luò)分層(network-basedstratification,NBS)的新方法,這種方法不是根據(jù)個體患者的異常突變,而是根據(jù)這些突變?nèi)绾斡绊懝蚕淼倪z傳網(wǎng)絡(luò)或系統(tǒng)來鑒別癌癥亞型。相關(guān)研究論文刊登在了近期出版的《自然-方法》(NatureMethods)雜志上。

研究人員表示,分型是朝著個體化醫(yī)療目標邁出的最基本的一步。根據(jù)患者的數(shù)據(jù),將患者歸類到與治療相關(guān)的亞型。例如,一種癌癥亞型已知對藥物A反應(yīng)很好,對藥物B則反應(yīng)不好。不進行分型,每位患者看起來當然都是一樣的,你不會想到如何采用不同的方法來治療他們。

近年來科學(xué)知識和技術(shù)的進展使得測序個體基因組變得更為容易且廉價,尤其是在癌癥治療中。而從根本上來說癌癥就是一種基因病。但基因非常的多樣化醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)搜集整理。突變基因組合在一起引起諸如癌癥等疾病,這種組合受到其他的因素影響。每位患者的癌癥在遺傳上都是獨特的,其可以影響著臨床治療的功效和結(jié)果。

研究人員指出,當你在基因水平上查看患者數(shù)據(jù)時,每個人看起來都是不同的。但是當你查看受到影響的生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)和系統(tǒng)時,分型就顯現(xiàn)出來。沒有基因在完全相同的地方發(fā)生突變,但是一些突變會出現(xiàn)在相同的遺傳信號通路中。

癌癥基因組圖譜(CancerGenomeAtlas)是由NIH提供資金、旨在收集和編錄成千上萬癌癥患者基因組的一項正在進行中的項目。在由癌癥基因組圖譜編譯的肺癌、子宮癌和卵巢癌患者數(shù)據(jù)中,科學(xué)家們特別查看了存在于腫瘤而不存在于健康組織中的體細胞突變。

研究人員表示,這種NBS方法具有直接的臨床價值。對癌癥患者進行基因組測序正快速成為標準診斷的一個組成部分。臨床醫(yī)生可以利用NBS來更好地匹配治療與癌癥亞型。通過記錄癌癥結(jié)果,并將這些結(jié)果集中輸入到數(shù)據(jù)庫中,他們可以進一步完善及改進癌癥治療,為患者定制出個體化治療。

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