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在α-酮戊二酸脫氫酶系作用下,α-酮戊二酸氧化脫羧生成琥珀酰CoA、NADH+、H+CO2,反應過程完全類似于丙酮酸脫氫酶系催化的氧化脫羧,屬于α氧化脫羧,氧化產生的能量中一部分儲存于琥珀酰CoA的高能硫酯鍵中。
α-酮戊二酸脫氫酶系也由三個酶(α-酮戊二酸脫羧酶、硫辛酸琥珀酰基轉移酶、二氫硫辛酸脫氫酶)和五個輔酶(TPP、硫辛酸、HSCoA、NAD+、FAD)組成。
此反應也是不可逆的。α-酮戊二酸脫氫酶復合體受ATP、GTP、NAPH和琥珀酰CoA抑制,但其不受磷酸化/去磷酸化的調控。