會議日期 | 2019-08-08至 2019-08-09 |
會議地點 | 廣東廣州 |
會議學科 | 其他臨床?颇[瘤科 |
主辦單位 | 上海遐永醫(yī)藥科技有限公司 |
學分情況 | 無 |
培訓預(yù)期:
1. 通過兩整天培訓,掌握TCGA,GEO數(shù)據(jù)庫的使用、下載及高通量數(shù)據(jù)分析思路和實用操作知識點。
2. 可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
3. 課后贈送1小時全場串聯(lián)視頻,用于學員復習。
4. 贈送一份最近5年的高價值國自然標書(醫(yī)藥加高價值標書庫里面選擇)
5. 講師團隊贈送TCGA數(shù)據(jù)庫甲基化、基因表達譜整合分析報告和疾病mRNA+lncRNA分析報告
講師簡介:宋偉博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
TCGA&GEO高通量數(shù)據(jù)挖掘分析班課表 |
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日期 |
時間 |
課程安排 |
內(nèi)容介紹 |
周六上午 |
9:00-10:00 |
生信簡介 |
生物信息介紹 |
高通量:測序及芯片介紹——多組學:轉(zhuǎn)錄組學、基因組學、表觀組學、宏基因組學等 |
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經(jīng)典生信SCI文章的思路解讀,了解TCGA數(shù)據(jù)庫、GEO數(shù)據(jù)庫及高通量測序數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結(jié)論并發(fā)文章的思路 |
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10:00-10:15 |
茶歇 |
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10:15-12:00 |
TCGA數(shù)據(jù)庫 NCBI GEO數(shù)據(jù)庫 |
TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介) |
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TCGA數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生過程 |
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TCGA官方數(shù)據(jù)庫的介紹和使用(包含了轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù)) |
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GEO數(shù)據(jù)庫介紹及使用:高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉(zhuǎn)換、差異分析等。 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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周六下午 |
13:30-15:00 |
TCGA相關(guān)下載工具 |
TCGA數(shù)據(jù)庫據(jù)下載:RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載 |
15:00-15:20 |
茶歇 |
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15:20-17:00 |
TCGA相關(guān)分析工具 |
TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關(guān)聯(lián)分析、生存分析、miRNA調(diào)控靶基因分析等。 |
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獲得生存曲線圖(KM曲線,分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線) |
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周日上午 |
8:30-10:30 |
TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) |
功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
聚類熱圖制作 |
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10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) |
蛋白互作分析(PPI)及網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 |
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網(wǎng)絡(luò)分析及hub蛋白/基因獲得。 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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周日下午 |
13:30-15:00 |
TCGA數(shù)據(jù)庫與GEO數(shù)據(jù)庫挖掘 |
基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 基于TCGA的甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合(meta)分析思路演練 |
15:00-15:20 |
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15:20-16:30 |
整體演練并錄屏 |
在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實戰(zhàn),及答疑 |
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注意事項:學員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為Heml,GSE |
【收費標準】
注冊費用:2800元/人,(會務(wù)費包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)
優(yōu)惠政策:
1. 提前報名并付款的,可以預(yù)先拿到學習資料
2. 三人組團報名,每人優(yōu)惠100元
3. 四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,
4. 五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊同價值學習班!
注意事項:必須攜帶win7以上系統(tǒng)的電腦,現(xiàn)場不得錄音錄像。提前安裝好Heml和GSE軟件(可提前向主辦方索要安裝包)
可開具正規(guī)會務(wù)費發(fā)票,提供紙質(zhì)蓋章邀請函;如需要電子版正式邀請函,請回復郵件或添加會務(wù)組微信索要;
【聯(lián)系我們】
楊敏 158-3834-2318(同微信)
報名郵箱:szkxym2016@126.com
QQ:1445908422
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