醫(yī)學會議中心

發(fā)布醫(yī)學會議通知

TCGA

會議日期 2019-08-08至 2019-08-09
會議地點 廣東廣州
會議學科 其他臨床?颇[瘤科
主辦單位 上海遐永醫(yī)藥科技有限公司
學分情況

培訓預(yù)期:

1. 通過兩整天培訓,掌握TCGA,GEO數(shù)據(jù)庫的使用、下載及高通量數(shù)據(jù)分析思路和實用操作知識點。

2. 可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。

3. 課后贈送1小時全場串聯(lián)視頻,用于學員復習。

4. 贈送一份最近5年的高價值國自然標書(醫(yī)藥加高價值標書庫里面選擇)

5. 講師團隊贈送TCGA數(shù)據(jù)庫甲基化、基因表達譜整合分析報告和疾病mRNA+lncRNA分析報告

講師簡介:宋偉博士

成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。

TCGA&GEO高通量數(shù)據(jù)挖掘分析班課表

日期

時間

課程安排

內(nèi)容介紹

周六上午

9:00-10:00

生信簡介

生物信息介紹

高通量:測序及芯片介紹——多組學:轉(zhuǎn)錄組學、基因組學、表觀組學、宏基因組學等

經(jīng)典生信SCI文章的思路解讀,了解TCGA數(shù)據(jù)庫、GEO數(shù)據(jù)庫及高通量測序數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結(jié)論并發(fā)文章的思路

10:00-10:15

茶歇

10:15-12:00

TCGA數(shù)據(jù)庫

NCBI GEO數(shù)據(jù)庫

TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介)

TCGA數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生過程

TCGA官方數(shù)據(jù)庫的介紹和使用(包含了轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù))

GEO數(shù)據(jù)庫介紹及使用:高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉(zhuǎn)換、差異分析等。

12:00-13:30

午餐及午休

周六下午

13:30-15:00

TCGA相關(guān)下載工具

TCGA數(shù)據(jù)庫據(jù)下載:RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載
TCGA數(shù)據(jù)書庫癌癥數(shù)據(jù)的處理,獲得關(guān)鍵mRNA、miRNA的表達譜矩陣。

15:00-15:20

茶歇

15:20-17:00

TCGA相關(guān)分析工具

TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關(guān)聯(lián)分析、生存分析、miRNA調(diào)控靶基因分析等。

獲得生存曲線圖(KM曲線,分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線)

周日上午

8:30-10:30

TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn)

功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析

聚類熱圖制作

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn)

蛋白互作分析(PPI)及網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建

網(wǎng)絡(luò)分析及hub蛋白/基因獲得。

12:00-13:30

午餐及午休

周日下午

13:30-15:00

TCGA數(shù)據(jù)庫與GEO數(shù)據(jù)庫挖掘

基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

基于TCGA的甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合(meta)分析思路演練

15:00-15:20

15:20-16:30

整體演練并錄屏

在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實戰(zhàn),及答疑

注意事項:學員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為Heml,GSE

【收費標準】

注冊費用:2800元/人,(會務(wù)費包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)

優(yōu)惠政策:

1. 提前報名并付款的,可以預(yù)先拿到學習資料

2. 三人組團報名,每人優(yōu)惠100元

3. 四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,

4. 五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊同價值學習班!

注意事項:必須攜帶win7以上系統(tǒng)的電腦,現(xiàn)場不得錄音錄像。提前安裝好Heml和GSE軟件(可提前向主辦方索要安裝包)

可開具正規(guī)會務(wù)費發(fā)票,提供紙質(zhì)蓋章邀請函;如需要電子版正式邀請函,請回復郵件或添加會務(wù)組微信索要;

【聯(lián)系我們】

楊敏 158-3834-2318(同微信)           

報名郵箱:szkxym2016@126.com

QQ:1445908422

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