會議日期 | 2020-10-03至 2020-10-06 |
會議地點 | 山東青島 |
會議學科 | 基礎醫(yī)學生物學 |
主辦單位 | 中科成創(chuàng)(北京)生物技術有限公司 |
學分情況 | 無 |
關于舉辦“10X Genomics單細胞轉錄組測序及多組學數(shù)據(jù)挖掘技術培訓班”通知
各有關單位:
隨著新一代單細胞測序技術的快速發(fā)展,在準確度大大提高的前提下, 進一步降低測序成本。由此不斷產生出巨量的分子生物學數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關系復雜的特點,以至于不利用計算機根本無法實現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲和分析。隨著生物信息學作為新興學科迅速蓬勃發(fā)展,正在改變人們研究生物醫(yī)學的傳統(tǒng)方式,單細胞技術以及數(shù)據(jù)分析技術已成為探索生物學底層機制和研究人類復雜疾病診斷、治療及預后的重要工具,廣泛應用于生命科學各個領域,是21世紀生命科學與生物技術的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。為進一步推動我國生物信息學特別是單細胞測序的發(fā)展,提高從業(yè)人員的技術水平,由中科成創(chuàng)(北京)生物技術有限公司舉辦“10X Genomics單細胞轉錄組測序及多組學數(shù)據(jù)挖掘技術培訓班”具體事宜通知如下:
一、培訓目標及特點:
本培訓以單細胞測序技術的應用與數(shù)據(jù)分析、單細胞轉錄組、多組學整合分析和結果解讀為主題,精心設計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。培訓邀請的主講人均是有理論和實際研究經驗的人員。學員通過與專家直接交流,能夠分享到這些頂尖學術機構的研究經驗和實驗設計思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路,在研究技術方面領悟更多。
二、培訓對象:
大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫(yī)學、化學、農學、計算機科學、數(shù)學類專業(yè)的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員;科研單位從事生物、生命科學、微生物研究的相關人員;生物、醫(yī)藥、化學及相關企業(yè)的領導與技術骨干。
三、時間地點: 2020年10月3日——10月6日 山東 青島
(時間安排:第1天報到,授課3天)
四、授課專家:
主講專家來自中科院科研機構的高級專家,擁有豐富的科研工作經驗,長期從事生物信息學方面的項目研究,發(fā)表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有資深的技術底蘊和專業(yè)背景,目前承擔國家科技部、國家自然基金委和市科技新星項目等多項課題。
五丶培訓內容:
單細胞測序技術與應用 |
1. 單細胞組學技術發(fā)展歷程和原理介紹。 2. 單細胞測序技術在科研領域的應用。 3. 近年單細胞方向高分文章思路解析。 4. 單細胞組學和多組學整合分析思路和案例介紹。 |
R語言入門與實操 |
1. R語言簡介及安裝,RStudio的安裝及使用說明。 2. R語言語法介紹及常用命令。 3. 數(shù)據(jù)處理功能及統(tǒng)計應用。 4. R語言畫圖實操。 |
單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析思路及流程 |
1. 單細胞實驗處理、建庫及測序。 2. 單細胞轉錄組比對、定量、分群及擬時間分析等分析思路。 3. 單細胞轉錄組轉錄因子及功能通路解析。 4. 單細胞組學技術在癌癥、發(fā)育、免疫及在植物、微生物等領域的研究內容及思路。 |
單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實操 |
1. 常規(guī)單細胞組學數(shù)據(jù)比對。 2. 10X官方單細胞軟件Cellranger講解及實操。 3. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。 4. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。 5. 單細胞轉錄組細胞鑒定及聚類分析。 6. 通過Seurat及GSVA等進行單細胞轉錄組差異分析。 |
多組學整合分析和結果解讀 |
1. 轉錄組,基因組,表觀分析介紹。 2. RNA和 ATAC-seq等多組學整合分析。 3. 常規(guī)10X單細胞ATAC數(shù)據(jù)測序原理簡介、分析流程介紹。 4. 單細胞免疫組庫測序技術及應用。 5. 組學分析常用數(shù)據(jù)庫介紹及使用。 |
單細胞轉錄組軌跡、通路、轉錄因子等分析及繪圖實操 |
1. 通過Monocle軟件進行單細胞轉錄組擬時間分析。 2. 通過DAVID及metascape網站進行通路富集分析。 3. 通過SCENIC軟件進行轉錄因子預測分析。 4. tSNE,小提琴圖,熱圖,網絡圖,GO、KEGG富集圖,GSEA等圖形繪制。 |
六、報名辦法及費用:
每人¥4300元(含報名費、培訓費、資料費、上機費)
團隊報名:3+1優(yōu)惠。(4位學員其中1位免除費用)
上課所有使用軟件與課件資料均可拷貝。
食宿可統(tǒng)一安排,費用自理。各單位人員報名參加,報名回執(zhí)表請回傳至會務處即可。
如單位有內訓需求,請將內訓方案傳至會務組,根據(jù)單位需求安排相應專家進行授課
七、 聯(lián)系方式:
聯(lián)系人:張琦 177 4456 9660
報名郵箱:zkcc_BIS@vip.163.com
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