會議日期 | 2019-12-26至 2019-12-29 |
會議地點 | 河南鄭州 |
會議學科 | 基礎醫(yī)學基礎醫(yī)學其他 |
主辦單位 | 中科成創(chuàng)(北京)生物技術有限公司 |
學分情況 | 無 |
“轉錄組學與全基因組重測序數(shù)據(jù)分析實操班”通知
各科研單位:
隨著新一代高通量測序技術的快速發(fā)展,在準確度大大提高的前提下, 進一步降低測序成本。由此不斷產(chǎn)生出巨量的分子生物學數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關系復雜的特點,以至于不利用計算機根本無法實現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲和分析。隨著生物信息學作為新興學科迅速蓬勃發(fā)展,正在改變?nèi)藗冄芯可镝t(yī)學的傳統(tǒng)方式,高通量測序技術以及數(shù)據(jù)分析技術已成為探索生物學底層機制和研究人類復雜疾病診斷、治療及預后的重要工具,廣泛應用于生命科學各個領域,是21世紀生命科學與生物技術的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。為進一步推動我國生物信息學特別是基因組學的發(fā)展,提高從業(yè)人員的技術水平。由中科成創(chuàng)(北京)生物技術有限公司具體承辦,具體事宜通知如下:
一、培訓目標及特點:
本培訓以轉錄組學與基因組學的應用與數(shù)據(jù)分析為主題,精心設計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。培訓邀請的主講人均是有理論和實際研究經(jīng)驗的人員。學員通過與專家直接交流,能夠分享到這些學術機構的研究經(jīng)驗和實驗設計思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路,在研究技術方面領悟更多。
二、授課專家:
主講專家來自中科院科研機構的專家,擁有豐富的科研工作經(jīng)驗,長期從事生物信息學方面的項目研究,發(fā)表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有技術底蘊和專業(yè)背景,目前承擔國家科技部、國家自然基金委和市科技新星項目等多項課題。
三、培訓對象:
大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫(yī)學、化學、農(nóng)學、計算機科學、數(shù)學類專業(yè)的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員;科研單位從事數(shù)據(jù)分析實驗室人員、生物、生命科學、微生物研究的相關人員;生物、醫(yī)藥、化學及相關企業(yè)的領導與技術骨干。
四、時間地點: 2019年12月26日——12月29日 河南 鄭州
(時間安排:第1天報到,授課3天)
五、培訓內(nèi)容:
第一天 |
9:00-12:00 Lunix系統(tǒng)講解 R語言 |
1.常規(guī)基礎Linux命令入門講解及實操訓練。 |
2.R語言簡介及安裝,RStudio的安裝及使用說明。 |
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3.R語言語法介紹及常用命令。 |
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4.R語言畫圖實操,tSNE,小提琴圖,熱圖,網(wǎng)絡圖,GO、KEGG富集圖等圖形繪制(實操)。 |
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13:30-17:30 轉錄組學數(shù)據(jù)分析在植物、動物、農(nóng)學、醫(yī)學等領域的應用理論講解 |
1.轉錄組技術發(fā)展前沿動態(tài)。 |
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2.轉錄組應用案例。 |
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3.轉錄組分析應用熱點。 |
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第二天 |
9:00-12:00 轉錄組數(shù)據(jù)分析流程及實操 |
1.轉錄組數(shù)據(jù)準備和軟件介紹。 |
2.轉錄組數(shù)據(jù)標準化。 |
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3.轉錄組數(shù)據(jù)比對。 |
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4.DESeq2進行表達量估計和分析(實操)。 |
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13:30-17:30 轉錄組數(shù)據(jù)挖掘和關聯(lián)分析上機實操 |
1. 轉錄組聚類分析(實操)。 |
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2.通過ggsurvival構建生存曲線(實操)。 |
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3.通過cox分析構建預后模型(實操)。 |
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4.lncRNA與mRNA關聯(lián)分析。 |
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5.個性化分析方案。 |
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第三天 |
9:00-12:00 基因組學學數(shù)據(jù)分析在植物、動物、農(nóng)學、醫(yī)學等領域的應用及上機操作 |
1. 基因組學生物信息學前沿技術動態(tài) |
2. 基因組重測序及數(shù)據(jù)分析 |
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3. 數(shù)據(jù)模擬(實操) |
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4. 數(shù)據(jù)過濾及質(zhì)量評估(實操) |
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5. SOAP/Bwa/Bowtie 等軟件的使用 |
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13:30-17:30 單細胞測序技術應用與案例介紹、10×單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析思路及流程 |
1. 單細胞組學技術原理和科研應用。 |
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2. 近年單細胞方向高分文章思路解析和案例介紹。 |
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3. 10×官方單細胞軟件Cell ranger講解及實操。 |
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4. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。 |
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5. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。 |
(*實際授課還會增加一些學員報名時反饋的感興趣內(nèi)容,希望參會人員可以把自己想了解的內(nèi)容,報名時一起填寫在回執(zhí)表上。大家在上課期間有什么問題,都可以隨時提出,如果有針對性問題可在 課間、課下和老師進行交流;)
六、報名辦法及費用:
每人¥3980元(含報名費、培訓費、資料費、上機費)
團隊報名:4+1優(yōu)惠。(5位其中1位免除費用)
食宿可統(tǒng)一安排,費用自理。各單位人員報名參加,報名回執(zhí)表請回傳至會務處即可。
如單位有內(nèi)訓需求,請將內(nèi)訓方案傳至會務組,根據(jù)單位需求安排相應專家進行授課
七、聯(lián)系方式:
聯(lián)系人:白嵐 138 1194 3959(微信)
郵箱:zkcc_BIS@vip.163.com
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