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岐阜藥科大學設有藥學部，藥學部下設制造藥學科和厚生藥學科兩個學科（入學定員120人），同時在大學院設有博士前、后期課程。從2006年度開始，導入了藥學部6年制度，將此前的2學科進行改組，重新編制成了畢業(yè)后可以取得藥劑師國家考試資格的6年制藥學科（入學定員100人），和以培養(yǎng)研究者為目標的4年制藥科學科（入學定員40人）醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理。雖然從藥科學科畢業(yè)之后無法直接取得藥劑師國家考試資格，但如果在藥學研究科進修1年碩士課程之后就可以取得考試資格了。 岐阜藥科大學采用了中期日程入學試驗，作為地方公立大學，校內(nèi)岐阜縣出身的學生只占10%左右，這在地方公立大學中是很少見的。2004年度畢業(yè)生參加藥劑師國家考試合格率為90.3%.包括大學院在內(nèi)的學生總數(shù)約640人。專職教師65名（其中52人具有博士學位）。
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