蘇州大學藥學教育最早可追溯至原東吳大學1949年創(chuàng)辦的藥學專修科，1952年全國院系調整并入華東藥專。1993年在原蘇州醫(yī)學院藥理學學科基礎上成立蘇州醫(yī)學院藥學系，2000年隨蘇州醫(yī)學院并入蘇州大學，2005年成立蘇州大學藥學院。

學院擁有藥學一級學科博士學位授權點、醫(yī)學|教育網搜集整理藥學一級學科博士后流動站、藥學一級學科碩士學位授權點、藥學碩士和工程碩士（制藥工程）專業(yè)學位授權點。建有1個省重點實驗室、1個省藥學學科綜合訓練中心、2個市級重點實驗室、2個校級科研機構。藥學學科為江蘇省高校優(yōu)勢學科建設工程一期項目，藥理學與毒理學（Pharmacology & Toxicology）學科2014年5月躋身ESI全球排名前1%.