溫州醫(yī)科大藥學院設有藥學系、中藥學系、生物制藥系、臨床藥學系、實驗教學中心和執(zhí)業(yè)藥師培訓與繼續(xù)教育中心�，F(xiàn)有4個本科專業(yè)：藥學、中藥學、制藥工程、臨床藥學。目前具有在校生約1000人（不含獨立學院——溫州醫(yī)科大學仁濟學院藥學系），其中博士研究生3人，碩士研究生180余人，本科生750余人，藥學自考生50余人。學院已形成從自考、本科到碩士、博士等多層次較完善的藥學教學體系。

醫(yī)科大藥學院共有教師95人，其中正高11人，副高20人，博士59人，博士生導師8人，碩士生導師42人。擁有國家高層次人才特殊支持計劃教學名師1人、“長江學者”特聘教授1人、“國家”1人、教育部新世紀優(yōu)秀人才1人、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選1人、國務院特殊津貼獲得者 1人、國家教學指導委員會委員2人；浙江省教學名師2人、浙江省教壇新秀2人、浙江省高校優(yōu)秀教師1人、浙江省有突出貢獻中青年專家1人、“錢江學者”1人、浙江省特聘教授1人、浙江省教學指導委員會委員2人、浙江省“”8人、及浙江省“151”和溫州市“551”一二層次人選、省中青年學科帶頭人和浙江省衛(wèi)生高層次創(chuàng)新人才等20余人。近幾年學院大力引進高水平師資，常年聘請國內(nèi)外藥學知名專家組成專家咨詢委員會，已形成一支結(jié)構(gòu)合理、水平較高的人才隊伍。