《南通大學學報（醫(yī)學版）》（原為《南通醫(yī)學院學報》）系江蘇省教育廳主管、南通大學主辦的綜合性醫(yī)學學術類期刊。1981年正式創(chuàng)刊（CN32—1142/R），1984年首批加入中國高校自然科學學報“CUJA系統(tǒng)數(shù)據庫”（E3.32250A），1988年加入國際連續(xù)出版物數(shù)據系統(tǒng)（ISSN1000—2057），1989年被國家科技論文研究課題組首批列為統(tǒng)計源期刊，1992年獲國際刊名代碼（CODEN NYIXEL）,同年被《中文核心期刊要目總覽》（北京大學出版社，1992，183-200）列為全國綜合性醫(yī)藥、衛(wèi)生類重要期刊，并在全國第一屆科技期刊評比中，榮獲交通部優(yōu)秀科技期刊獎；1996年首批加入《中國學術期刊（光盤版）》。1999年被列為“醫(yī)學類核心期刊”，同時被評為江蘇省優(yōu)秀自然科學學報二等獎，2004年成為江蘇省一級期刊。被《中國核心期刊（遴選）數(shù)據庫》收錄，榮獲中國學術期刊光盤版編輯委員會授予的首屆《CAJ-CD規(guī)范》執(zhí)行優(yōu)秀期刊獎，入選中國學術期刊綜合評價數(shù)據庫統(tǒng)計源期刊，《中國醫(yī)學文摘》系列檢索期刊論文摘錄對象。

《南通大學學報（醫(yī)學版）》主要刊載本校和附屬醫(yī)院、教學實習醫(yī)院及其他醫(yī)療衛(wèi)生單位的科研教學人員、醫(yī)療衛(wèi)生工作者在基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學、祖國醫(yī)學以及航海醫(yī)學等學科領域中的研究成果。