北京大學(xué)藥學(xué)院是全國重點藥學(xué)院（系）之一，也是國家最早建立的高等藥學(xué)院校之一，其前身是北京大學(xué)中藥研究所，始建于1941年。在此基礎(chǔ)上，1943年建立北京大學(xué)醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系；1952年醫(yī)學(xué)院獨立建院，隨之改名為北京醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系；1985年隨學(xué)校更名為北京醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院；2000年4月更名為北京大學(xué)藥學(xué)院。曾設(shè)本草、制藥、藥學(xué)、藥檢、藥物化學(xué)、生藥學(xué)、應(yīng)用化學(xué)（醫(yī)藥）、藥理學(xué)等專業(yè)，現(xiàn)設(shè)藥學(xué)專業(yè)（六年制本碩連讀）。藥學(xué)專業(yè)于2007、2008年被批準(zhǔn)為國家級、北京市級高等學(xué)校特色專業(yè)建設(shè)點，于2008年被批準(zhǔn)為“國家理科基礎(chǔ)科學(xué)研究和教學(xué)人才培養(yǎng)基地”（簡稱理科基地）藥學(xué)專業(yè)點。北京大學(xué)藥學(xué)院是一個以培養(yǎng)研究型人才為目標(biāo)的藥學(xué)院。

藥學(xué)院走過了半個多世紀(jì)的歷程，在學(xué)科建設(shè)、師資培養(yǎng)、教學(xué)、科研等方面都得到巨大的發(fā)展。曾培養(yǎng)出一大批科學(xué)家，是國內(nèi)外藥學(xué)科學(xué)家培養(yǎng)的搖籃。至今藥學(xué)院已有四名教授遴選院士，其中王序教授、王夔教授、張禮和教授為中國科學(xué)院院士，樓之岑教授為中國工程院院士。

1943-1945年劉思職教授任系主任，1945-1947年陳同度教授任系主任，1947-1958年薛愚教授任系主任，1958-1966年王序教授任系主任，1978-1983年王序教授任系主任，1983-1988年王夔教授任系主任、院長，1988-1999年張禮和教授任院長。1999-2004年彭師奇教授任院長；2004-2005年劉俊義教授任常務(wù)副院長；2005年-今，劉俊義教授任院長。

藥學(xué)院由六系（化學(xué)生物學(xué)系，藥物化學(xué)系，天然藥物學(xué)系，藥劑學(xué)系，分子與細(xì)胞藥理學(xué)系，藥事管理與臨床藥學(xué)系）、一室（天然藥物及仿生藥物國家重點實驗室）、一所（應(yīng)用藥物研究所）、一中心（藥學(xué)實驗教學(xué)中心）組成。下設(shè)四個委員會：教學(xué)委員會、學(xué)術(shù)委員會、藥物研究與開發(fā)委員會、對外合作交流委員會。

北京大學(xué)藥學(xué)學(xué)科于2007年被認(rèn)定為國家一級重點學(xué)科，在教育部2012年學(xué)科評估中排名第一，下有三個國家二級重點學(xué)科即藥物化學(xué)、生藥學(xué)及藥理學(xué)，一個衛(wèi)生部重點專科即臨床藥學(xué)和一個國家中醫(yī)藥管理局重點學(xué)科即中藥分析學(xué)。藥學(xué)學(xué)科是藥學(xué)博士后流動站和“大藥學(xué)”博士點，學(xué)院各二級學(xué)科均可招收博士生。學(xué)院現(xiàn)有7個碩士點、博士點即藥物化學(xué)、生藥學(xué)、藥理學(xué)、藥劑學(xué)、藥物分析學(xué)、化學(xué)生物學(xué)、臨床藥學(xué)。學(xué)院在校各類學(xué)生1515人，其中博士研究生173人、統(tǒng)招碩士研究生251人、在職申請學(xué)位研究生30余人、六年制本碩連讀學(xué)生636人、成人教育專升本學(xué)生454人。

學(xué)院注重師資隊伍的建設(shè)工作，逐漸形成了一支以學(xué)識淵博、治學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶＜覍W(xué)者為核心的師資隊伍，其中包括中國科學(xué)院院士2名，國家“973”計劃項目首席科學(xué)家3名，“長江學(xué)者獎勵計劃”特聘教授3名，國家“青年入選者2人，中組部首批青年拔尖人才1人，國家杰出青年基金獲得者6名，教育部創(chuàng)新團隊4個，教育部跨世紀(jì)（新世紀(jì)）人才12名，國家優(yōu)秀青年科學(xué)基金獲得者4人，北京市科技新星計劃入選者4人，全國優(yōu)秀教師1名，北京市教學(xué)名師3名，北京市優(yōu)秀教師8名。學(xué)院現(xiàn)有在職職工179名，其中教授（研究員）41名、副教授（副研究員）52名，博士生導(dǎo)師44名、碩士生導(dǎo)師54名，具有博士學(xué)位的教師105名，占專任教師總數(shù)的75.5%，具有碩士學(xué)位的教師27名，占專任教師總數(shù)的19.4%.

學(xué)院以創(chuàng)建一流大學(xué)為目標(biāo)，進一步轉(zhuǎn)變教育教學(xué)思想，更新“教與學(xué)”的觀念，狠抓教育質(zhì)量。學(xué)院為適應(yīng)高等教育教學(xué)改革的發(fā)展和社會對高層次藥學(xué)人才的需求，2001年經(jīng)教育部批準(zhǔn)，北京大學(xué)藥學(xué)院在國內(nèi)率先以大藥學(xué)一級學(xué)科招收六年制學(xué)—碩連讀學(xué)生，探索研究型藥學(xué)人才培養(yǎng)的全新模式，學(xué)院提出并實踐了藥學(xué)專業(yè)六年一貫制、學(xué)—碩融通的研究型創(chuàng)新人才的培養(yǎng)模式，在課程體系、教學(xué)內(nèi)容、教學(xué)組織形式、實踐環(huán)節(jié)、學(xué)生思想建設(shè)等方面都進行了改革與創(chuàng)新，突破了舊有的模式，在教育教學(xué)上取得了顯著成績。近年來獲國家級教學(xué)成果二等獎1項、北京市教學(xué)成果一等獎2項、北京市教學(xué)成果二等獎1項、教育部“全國普通高等學(xué)校優(yōu)秀教材”二等獎1項、全國高等學(xué)校醫(yī)藥優(yōu)秀教材二等獎1項，有7部教材被評為北京市高等教育精品教材，有1門課程被評為國家級精品資源共享課；藥學(xué)實驗教學(xué)中心被評為北京市高等學(xué)校實驗教學(xué)示范中心和國家級實驗教學(xué)示范中心建設(shè)單位；承擔(dān)教育部新世紀(jì)高等教育教學(xué)改革工程項目1項、教育部世行貸款21世紀(jì)初高等教育教學(xué)改革項目醫(yī)藥類項目1項、國家“十五”重點立項課題子項目5項、北京市共建項目4項、中國高等教育學(xué)會‘十一五’教育科學(xué)研究規(guī)劃課題5項、中國高等教育學(xué)會醫(yī)學(xué)教育專業(yè)委員會藥學(xué)教育研究會立項課題6項、北京市創(chuàng)新性實驗計劃1項、教育部創(chuàng)新性實驗計劃4項，并于2008年獲準(zhǔn)國家基礎(chǔ)科學(xué)人才培養(yǎng)基金能力提高項目的資助。

學(xué)院的科學(xué)研究主要集中在“三大疾病”即心腦血管疾病、腫瘤、老年性疾病；以及在核酸、寡糖、多肽和微量元素“四大內(nèi)源性物質(zhì)”和天然藥物等領(lǐng)域的基礎(chǔ)研究。以國家重點實驗室（天然藥物及仿生藥物國家重點實驗室）為核心，重點學(xué)科（藥物化學(xué)、生藥學(xué)、藥理學(xué)）為依托，在核酸化學(xué)、多肽化學(xué)、糖化學(xué)、生物無機化學(xué)等方面積累了較雄厚的基礎(chǔ)，取得了國內(nèi)領(lǐng)先、國際上有影響的成績，有些學(xué)科和研究成果已達(dá)到國際水平。

目前學(xué)院承擔(dān)著多項國家自然科學(xué)基金重大及重點項目、國家“973”計劃項目、國家“863”計劃項目、國家科技支撐計劃項目、國家科技重大專項項目以及省部級科研項目，參與了“211工程”及“985工程”建設(shè)。學(xué)院近年獲國家自然科學(xué)二等獎4項，省部級一等獎6項、二等獎23項、三等獎8項，其他獎20余項；近五年獲得發(fā)明專利85項，發(fā)表研究論文1422篇（其中被SCI收錄的950篇）。有1個抗腫瘤一類新藥被SFDA批準(zhǔn)進入II期臨床研究，1個抗腫瘤的一類新藥和1個抗癲癇的一類新藥被SFDA批準(zhǔn)進行臨床研究。2009年以來，藥學(xué)院積極面向國家重大需求，聯(lián)合學(xué)校有關(guān)新藥研發(fā)機構(gòu)和企業(yè)，利用藥學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)、化學(xué)、計算機科學(xué)等綜合學(xué)科的優(yōu)勢和堅實的研究基礎(chǔ)，整合北大優(yōu)勢資源，承擔(dān)了國家“重大新藥創(chuàng)制”科技重大專項課題“北京大學(xué)綜合性創(chuàng)新藥物研究開發(fā)技術(shù)大平臺的建設(shè)”。構(gòu)建從創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)至新藥研發(fā)整體環(huán)節(jié)，包括化學(xué)藥、中藥/天然藥、生物技術(shù)藥在內(nèi)的創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)與研發(fā)體系，以提高學(xué)院新藥研究的自主創(chuàng)新能力，為國家實現(xiàn)從醫(yī)藥大國到醫(yī)藥強國的轉(zhuǎn)變貢獻(xiàn)力量醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)編輯整|理。

學(xué)院已建立藥物篩選中心、核磁中心、液質(zhì)中心、生物測試平臺、普通化學(xué)測試平臺等藥學(xué)分析測試技術(shù)平臺。擁有600M、500M、400M、300M核磁共振波譜儀、LC-MS液質(zhì)聯(lián)用儀、高分辨質(zhì)譜測試儀、EPS-300型電子自旋共振波譜儀、等離子表面共振儀、計算機輔助藥物設(shè)計工作站、毛細(xì)管電泳儀、全自動高通量藥物篩選機器人工作站、高內(nèi)涵篩選儀、全自動膜片鉗系統(tǒng)、石英晶體微天平、全波長掃描式多功能讀數(shù)儀，小動物成像儀等藥物科學(xué)研究領(lǐng)域一流的大型測試儀器，為全�？蒲泻徒虒W(xué)提供技術(shù)保障，并向社會提供測試服務(wù)和專業(yè)技術(shù)培訓(xùn)。

藥學(xué)院與國際國內(nèi)科研院所、制藥企業(yè)有著廣泛的合作與交流。與美國、英國、法國、德國、日本、荷蘭等國家及港、澳、臺地區(qū)等十幾所大學(xué)或公司建立了友好合作關(guān)系，聘請外籍名譽教授4名、客座教授12名，對內(nèi)、對外交流的擴大和加深促進了藥學(xué)院整體地位與水平的穩(wěn)步提高。