這一時期起始于18世紀末至20世紀中。其特點是人們對免疫功能的認識從人體現象的觀察進入了科學實驗時期。它的發(fā)展是與微生物學的發(fā)展密切相關的，并成為微生物學的一個分支。這一時期內的重要成就如下述。

　　1.牛痘苗的發(fā)明 繼人痘苗之后，免疫學的一個重要發(fā)展首推牛痘苗的發(fā)明。它不但彌補了人痘苗的不足，并且可在實驗室大量生產，于1804年傳入我國后很快代替了人痘苗。

　　牛痘苗的發(fā)明應歸功于英國醫(yī)生Jenner，他觀察到擠奶女工在患過牛痘后不易得天花病的事實后，通過對牛痘苗人體的長期實驗，確證接種牛痘苗后可以預防天花，并對人體無害。在1793年發(fā)表了他的牛痘苗著作，為人類傳染病的預防開創(chuàng)了人工免疫的先聲。

　　2.減毒疫苗的發(fā)明 免疫學的發(fā)展自Jenner發(fā)明牛痘苗之后，停滯了將近一個世紀。進入19世紀后微生物學在法國免疫學家Pasteur和德國細菌學家Koch 等人的努力下得到了迅速發(fā)展。在方法學上創(chuàng)造性地解決了細菌的分離培養(yǎng)，從而能獲得純種細菌，為人工菌苗的制備創(chuàng)造了條件。Pasteur更有意識的研究獲得減毒菌株的方法，通過系統(tǒng)的科學實驗，終于發(fā)現了應用物理、化學以及生物學方法可獲得減毒菌株。

　　在1881年 Pasteur應用高溫培養(yǎng)法獲得了減毒株，從而制備了炭疸菌苗。醫(yī).學教育網搜集整理其后他又將狂犬病毒在兔體內經連續(xù)傳代獲得了減毒株，從而制備了炭疸菌苗。巴氏減毒菌苗的發(fā)明為實驗免疫學建立了基礎。

　　3.抗毒素的發(fā)明 德國學者Behring和日本學者北里于1890年在Koch研究所應用白喉外毒素給動物免疫，發(fā)現在其血清中有一種能中和外毒素的物質，稱為抗毒素。將這種免疫血清轉移給正常動物也有中和外毒素的作用。醫(yī).學教育網搜集整理這種被動免疫法很快應用于臨床治療。Behring于1891年應用來自動物的免疫血清成功地治療了一個白喉患者，這是第一個被動免疫治療的病例。為此他于1902年獲得了諾貝爾醫(yī)學獎。

　　4.補體的發(fā)現 19世紀末，繼抗毒素之后，又限快發(fā)現了免疫溶菌現象。Pfeiffer（1894）用新鮮免疫血清在豚鼠體內觀察到對霍亂弧菌的溶菌現象。Bordet發(fā)現如將新鮮免疫血清加熱60℃30分鐘可喪失溶能力。他認為在新鮮免疫血清內存在二種不同物質與溶菌作用有關。一種對熱穩(wěn)定的物質稱為溶菌素即抗體，有特異性，另一種對熱不穩(wěn)定的物質，可存在于正常血清中，為非特異性成分，稱之為補體。它具有溶菌或溶細胞作用，但這種作用必需有抗體存在才能實現。

　　5.血清學方法的建立 在抗毒素發(fā)現以后的10年中，相繼在免疫血清中發(fā)現有溶菌素、凝集素、沉淀素等特異性組分，并能與其相應細胞或細菌發(fā)生反應。其后將多種不同的特異性反應物質統(tǒng)稱之為抗體。將能引起抗體產生的物質統(tǒng)稱之為抗原，自此建立了抗原、抗體的概念。在此期間建立了各種體外檢測抗原、抗體反應的血清學技術如沉淀反應、凝集反應、補體結合反應等方法，為病原菌的鑒定和血清抗體的檢查提供了可靠的方法。從而大大有助于傳染病的診斷學和流行病學調查，而動物免疫血清的制備又開創(chuàng)了被動血清療法。