（1）膽汁淤積，久之肝硬化。

（2）門靜脈高壓

1）巨大囊腫壓迫門靜脈引起肝外型門靜脈高壓，內引流術可緩解。

2）晚期肝硬化引起肝內門靜脈高壓。預后較差。

（3）膽系感染：反復發(fā)作膽管炎、膽囊炎，使抵抗力下降。

（4）胰腺炎：胰膽合流異常，引起急慢性胰腺炎，胰管擴張。

（5）膽系結石形成；長期膽汁淤滯、感染的結果。

（6）膽總管穿孔：囊內壓力加大，在囊壁薄弱處穿孔，好發(fā)部位多在膽囊管與膽總管交界處附近，穿孔后可引起急性膽汁性腹膜炎。

（7）囊腫壁癌變：由于炎癥、潰瘍、胰液刺激、再生或化生的基礎上引起，預后不良，此病癌變率2.5％～4％。