腹瀉的原發(fā)疾病或病因診斷主要須從病史、癥狀、體征、常規(guī)化驗特別是糞便檢驗中獲得依據(jù)。許多病例通過仔細分析病史和上述檢查的初步結果，往往可以得出正確診斷。

若診斷仍不清楚，可進一步作X線鋇灌腸和鋇餐檢查，和（或）直、結腸鏡檢查。如仍無明確結論，則須根據(jù)不同情況選用超聲、CT、內鏡逆行膽胰管造影（ERCP）等影象診斷方法以檢查膽、胰疾病，或進行小腸吸收功能試驗、呼氣試驗、小腸粘膜活檢以檢查小腸吸收不良。

高度懷疑腸結核、腸阿米巴病等有特效治療的疾病，經(jīng)過努力都不能確診時，可在一定限期內進行治療試驗。

反復多次查大便常規(guī)，病原學檢查，各種細菌培養(yǎng)、查阿米巴原蟲及病毒等。此外，專家認為還可以通過下列檢查來診斷慢性腹瀉：（字數(shù)限制，詳情參看）

1．指診。

2．乙狀結腸鏡檢查。

3．纖維腸鏡檢查。

4．鋇灌腸。

5．內鏡逆行胰膽管造影(ERCP)有重要價值。

6．X線鋇餐、鋇灌腸檢查和腹部平片。

7．B超、CT或MRI(核磁共振）

怎么通過糞便形狀來診斷腹瀉原因

（1）若糞便為灰白色，可能是結石、腫瘤、蛔蟲等引起膽道梗阻，導致膽黃素無法隨大便排出；

（2）若為黑色，在沒有進食動物血制品和黑色的食物、藥物的前提下，則可能是上消化道出血；

（3）糞便為紅色則常提示下消化道出血；

（4）有柏油樣腥臭味的糞便常提示痢疾；

（5）淡黃色則提示脂肪消化不良；

（6）多泡沫、酸臭味一般多為糖消化不良；

（7）惡臭則為蛋白質消化不良以及腸道有害菌多。

（8）大便中還能直接看到寄生蟲或者蟲多為寄生蟲導致。