經(jīng)過全國十幾所高等藥學院校及有關專家調(diào)研論證，執(zhí)業(yè)藥師繼續(xù)教育整個課程體系分為兩大類，一是藥學類，二是中藥學類。

每一大類里又分為專業(yè)基礎課、專業(yè)課、拓展課和研討課四種醫(yī)|學教育|網(wǎng)整理，課程總數(shù)為32門。藥學類共設20門課程，其中專業(yè)基礎課3門、專業(yè)課6門、拓展課6門、研討課5門。中藥學類共設20門課程。其中專業(yè)基礎課4門、專業(yè)課6門、拓展課5門、研討課5門。在藥學類和中藥學類課程中，內(nèi)容完全相同的有8門課程，故采用同一個教學大綱，稱為共用課程。

如果同時考取了執(zhí)業(yè)中藥師和執(zhí)業(yè)西藥師，繼續(xù)教育時只要取得15學分即可，也就是說不用為了兩個證書分別繼續(xù)教育。