已知生物堿種類很多，約在10，000種左右，有一些結(jié)構式還沒有完全確定。它們結(jié)構比較復雜，可分為59種類型。隨著新的生物堿的發(fā)現(xiàn)，分類也將隨之而更新。由于生物堿的種類很多，各具有不同的結(jié)構式，因此彼此間的性質(zhì)會有所差異。但生物堿均為含氮的有機化合物，總有些相似的性質(zhì)，因為在其生物合成的途徑中氨基酸是起始物，主要有鳥氨酸、賴氨酸、苯丙氨酸、組氨酸、色氨酸等，主要經(jīng)歷兩種反應類類型：環(huán)合反應和碳——氮鍵的裂解，所以總有些性質(zhì)相似。

生物堿具環(huán)狀結(jié)構，難溶于水，與酸可以形成鹽，有一定的旋光性和吸收光譜，大多有苦味。呈無色結(jié)晶狀，少數(shù)為液體。生物堿有幾千種，由不同的氨基酸或其直接衍生物合成而來，是次級代謝物之一，對生物機體有毒性或強烈的生理作用。