安徽中醫(yī)學(xué)院研究生部于1978年開始招收研究生，安徽中醫(yī)學(xué)院研究生部1981年成為碩士學(xué)位授予單位。現(xiàn)擁有碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)18個(gè)，在校全日制研究生489人，外籍研究生10余名，并開展了在職人員以研究生同等學(xué)力申請(qǐng)碩士學(xué)位、安徽中醫(yī)學(xué)院研究生部的臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)位及高校教師在職攻讀碩士學(xué)位等多種途徑的研究生培養(yǎng)和學(xué)位授予工作。