mRNA（信使核糖核酸）在蛋白質合成過程中起著關鍵的作用，它將DNA上的遺傳信息轉錄成可以被翻譯成蛋白質的形式。具體來說，mRNA指導氨基酸排列的機制如下：
1. 轉錄過程：首先，在細胞核內，特定基因區(qū)域的DNA雙鏈會解開，其中一條鏈作為模板，通過一系列酶（主要是RNA聚合酶）的作用合成一段與之互補的mRNA分子。
2. 剪接和加工：新合成的mRNA前體還需要經過剪接等加工步驟，去除不編碼蛋白質的部分（內含子），保留編碼部分（外顯子）。這樣形成成熟的mRNA，然后從細胞核轉移到細胞質中。
3. 翻譯過程：在細胞質中的核糖體上開始翻譯過程。每個mRNA上的三個連續(xù)的堿基組成一個密碼子，不同的密碼子對應特定的氨基酸或終止信號。tRNA（轉運RNA）攜帶相應的氨基酸，并通過其反密碼子與mRNA上的密碼子配對。
4. 氨基酸鏈形成：隨著核糖體沿著mRNA移動，每一步都會將新的氨基酸添加到正在增長的多肽鏈上。當遇到終止密碼子時，翻譯過程結束，釋放出完整的蛋白質分子。

通過這種方式，mRNA上的遺傳信息就被準確地轉化為特定序列的氨基酸，進而折疊成具有生物活性的蛋白質。