設計病原體基因的特異引物，細菌標本（不經培養(yǎng)）經過簡單裂解、變性后，就可在PCR儀上進行擴增反應，經過25～30個循環(huán)，通過瓊脂糖電泳即可觀察擴增結果，檢出病原體。這種技術的特點是簡便、快速。它尤其適于那些培養(yǎng)時間較長的病原菌的檢查，如結核桿菌、支原體等。PCR高度的敏感性使該技術在病原體診斷過程中極易出現假陽性，避免污染是提高PCR診斷準確性的關鍵環(huán)節(jié)。

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