已成為IE治療的重要手段，可清除藥物難以治愈的病原體感染病灶，還能為抗生素的選擇提供直接依據(jù)；可切除受到感染且嚴重受損的心瓣膜，有效恢復(fù)心瓣膜的機械功能，重建穩(wěn)定的血流動力學(xué)狀態(tài)；可消除栓塞的來源，減少和防止嚴重合并癥的發(fā)生，還可顯著改善預(yù)后，降低病死率。

　　外科手術(shù)的主要指征包括：①經(jīng)抗生素治療仍發(fā)生心瓣膜功能不全并導(dǎo)致中度以上的充血性心力衰竭；②反復(fù)發(fā)生內(nèi)臟器官栓塞；③未能控制的感染，經(jīng)大劑量多種抗生素合用，血培養(yǎng)仍持續(xù)陽性；④真菌性心內(nèi)膜炎；⑤出現(xiàn)嚴重合并癥，內(nèi)科治療不可能改善的，如主動脈瓣受累導(dǎo)致房室傳導(dǎo)阻滯或束支傳導(dǎo)阻滯、室間隔膿腫形成或破裂、腱索或乳頭肌斷裂、主動脈竇破裂等；⑥PVE經(jīng)治療仍有瓣周漏、瓣膜移位、裂開、梗阻、瓣周或心肌膿腫等；⑦化膿性心包炎。

　　外科手術(shù)的相對指征有：①巨大的贅生物（>10mm），發(fā)生全身性栓塞的危險性很高；②左側(cè)瓣膜（主動脈瓣、二尖瓣）金黃色葡萄球菌性IE，此種感染極難控制且死亡率高；③培養(yǎng)陰性的心內(nèi)膜炎伴原因不明持續(xù)發(fā)熱超過10天，尤其PVE患者在經(jīng)驗性抗生素治療期間仍有發(fā)熱；④抗生素治療有效但又復(fù)發(fā)的NVE；⑤其他情況如革蘭陰性細菌感染、非鏈球菌性PVE、早期的PVE、新出現(xiàn)的人工瓣瓣周漏等。