蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)可以分為四級，分別是：

一級結(jié)構(gòu)：指蛋白質(zhì)中氨基酸的線性排列順序。這是由肽鍵連接起來的一系列氨基酸殘基所構(gòu)成的基本骨架。

二級結(jié)構(gòu)：是指蛋白質(zhì)主鏈原子通過氫鍵形成的局部空間構(gòu)象，主要包括α-螺旋和β-折疊等規(guī)則結(jié)構(gòu)。這些結(jié)構(gòu)是由于蛋白質(zhì)分子內(nèi)部或相鄰肽段之間的氫鍵作用而形成的。

三級結(jié)構(gòu)：指的是整個(gè)多肽鏈中所有原子的空間排布情況，即蛋白質(zhì)的整體三維構(gòu)型。它是由二級結(jié)構(gòu)單元通過各種非共價(jià)相互作用（如疏水作用、范德華力、靜電相互作用等）折疊而成的復(fù)雜形狀。

四級結(jié)構(gòu)：對于由多個(gè)亞單位組成的蛋白質(zhì)而言，其各個(gè)亞基之間的相對位置和排列方式稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。這種結(jié)構(gòu)是通過不同肽鏈間的非共價(jià)鍵來維持穩(wěn)定的。并非所有的蛋白質(zhì)都具有四級結(jié)構(gòu)，只有當(dāng)一個(gè)蛋白質(zhì)分子包含兩個(gè)或更多個(gè)獨(dú)立折疊的多肽鏈時(shí)才存在四級結(jié)構(gòu)。